也就是保守治疗，通常是采用性激素进行治疗，原理就是通过抑制雌激素合成，使得异位的内膜出现萎缩。如果病症不大的话，此方法还是可以试一试。但是如果是异位的病症较大的囊肿，在采用，几乎没有什么效果了，只能采用。
对于一些想要快速根治巧克力囊肿的患者来说，采用是最好的治疗方法，尤其是囊肿较大的患者。腹腔镜微创手术是一个可以根治巧克力囊肿的方法。巧克力囊肿患者平时有痛经、性交痛、经血改变和不育等麻烦，因此及早治疗是很关键的。腹腔镜微创技术是一种无痛、无创、副作用小、恢复快的技术，也是目前最受卵巢巧克力囊肿所亲睐的一种技术。
